科学技术发展院和科学技术协会合署办公，设有综合处、自然科学处和人文社会科学处（社会科学联合会），下设综合办公室、自然科学项目管理办公室、自然科学成果及平台管理办公室、人文社会科学项目管理办公室、人文社会科学平台与团队管理办公室（社科联秘书处）和科协办公室（校学术委员会秘书处）六个科室。共有工作人员10人（含挂职干部2人），现有领导班子成员3人，其中科发院负责人1人，主管部门工作，分管综合工作的副院长1人，分管人文社会科学工作的负责人1人。